农村合作医疗和社会保险中的医疗保险是有冲突的。
新农合和五险一金在缴纳方面不冲突，在报销的时候只能有一个报销。从缴纳方面来说，五险一金和新农合是可以同时买的，这个并不冲突。
农村合作医疗和五险中的医疗保险是不冲突的，但是两者同时参加的，不会存在两个一起报销了，只能报销一个，合作医疗跟五险一金是没有冲突的。只是双重购买没有必要的。
合作医疗和五险一金不冲突。合作医疗和五险一金不需要同时交。因为新农村农村合作医疗和五险中的医疗保险是冲突的，合作医疗和五险一金不能同时参加。
村里的新农合和单位交的五险一金在缴纳上不冲突。在报销的时候只能有一个报销。从缴纳方面来说，五险一金和新农合是可以同时买的，这个并不冲突。
五险一金和农村合作医疗有冲突。从缴纳方面来说，五险一金和农村合作医疗可以同时购买，但在报销费用时不能同时使用。五险一金覆盖范围更广，适用于所有企业员工和灵活就业者，而农村合作医疗仅适用于农村户口人口。
法律分析：新农合跟五险冲突，农村合作医疗和五险中的医疗保险是冲突的，两者是不能同时参加的，所以就不会存在两个一起报销了，只能报销一个。从现阶段报销的比例来看，如果缴纳社保，就直接用社保报销比较划算，停止缴纳新农合。
1、合作医疗和医保相冲突。农村合作医疗和公司上的社会保险是有冲突的，不能同时享受两种待遇。如果参加公司上的社会保险，就注销农村合作医疗。另外农村合作医疗每年缴费一次，不产生个人账户余额，所以不存在转移费用。
2、新农合的医保，和社保卡的医保是有冲突的，缴纳了职工医疗保险，就不能缴纳新农合医保，更不能同时享受新农合和职工医保，报销两次的，只能享受二者其中的一个医保。享受了职工医保就不能享受新农合报销； 。
3、社保医保和农村合作医疗保险冲突。新农合和社保不能并存，是可以相互转化的。
4、【法律分析】：农村合作医疗和公司上的社会保险有冲突，只能报销一份。城镇医疗保险包括城镇职工医疗保险、城镇居民医疗保险等等。
5、农村合作医疗和社保冲突是有一定冲突的，尤其是社保当中的医疗保险。当出险时，用户不能同时享受到农村合作医疗和社保中的医疗保险，因此这二者大家参保一款即可。
6、不能同时交，新农合和职工医保有冲突，国家规定不得重复参加。但如果是在农村，会出现同时都交了的情况，不过不管怎样都是不能同时报销。